20世纪后期，该基地的主要作用是收留在公海上拦截的古巴和海地难民。美国中央情报局的国别数据统计表显示，2014财年(从2013年10月1日至2014年9月30日)，美国共接收了4062名来自古巴的难民。“9·11”事件后，美国将抓获的数百名“基地”组织成员和塔利班嫌犯关押在该基地。

　　现场留下的那些血红的抗议颜料也预示着两国进一步深化关系仍面临不少挑战。主持开馆仪式的古巴外交部长布鲁诺·罗德里格斯表示，只有美国解除对古巴的经济、贸易及金融封锁，归还被侵占的关塔那摩及尊重古巴的主权，互设大使馆这一历史性事件才能展现其“真正的实质意义”。

　　美国国务卿克里表示，两国互设大使馆是“在正确的方向上迈出的历史性一步”，彼此接触比相互疏远能够更好地服务两国的利益。美国民意调查机构皮尤研究中心发布一份民调结果显示，63%的美国民众支持美国和古巴恢复外交关系，三分之二的人支持取消美国对古巴的贸易禁运。

　　1996年，美国通过《古巴自由和民主声援法》（亦称《赫尔姆斯——伯顿法》），对古巴封锁与制裁进一步加剧。更让外界难以理解的是，该法规定，可以在美国法庭上起诉在古巴拥有投资项目的第三国企业。这一带有明显的治外法权特征的立法被视为美国霸道行为的一个极为明显的体现。

　　当前仍然有效的《赫尔姆斯——伯顿法》规定，妥善解决这些财产争议是美国全面恢复与古巴的外交与经济关系的“关键条件”。分析称，在为这一复杂的历史问题找到最终方案之前，两国经贸合作将不可避免受到严重影响。

　　美国首都华盛顿新添的两面国旗见证了美国开始全面恢复与古巴的关系。在美国国务院大厅内，按照字母顺序排列，一面20日凌晨新上架的古巴国旗紧邻克罗地亚国旗，隔7面旗帜与中国国旗相邻。美国国务院最新数据显示，在美国所承认的全球195个独立国家中，仅剩不丹、伊朗及朝鲜勤国未与美国建交。

　　但星条旗重新在古巴首都哈瓦那飘扬则还需等一段时间。克里计划下个月访问古巴时，亲自在美国驻古巴大使馆的6层小楼前升旗。克里表示，8月14日能够在美国驻古巴大使馆升起54年来的第一面美国国旗，是“他的荣幸”。

　　美国在20日当天也派出庞大代表团出席了驻古巴大使馆开馆仪式。超过500人的代表团由负责西半球事务的助理国务卿罗伯塔·雅可布森率领，包括总统国家安全事务副助理本·罗兹及国家安全委员会负责西半球事务的高级主任马克·范因斯坦。

　　美国对古巴的全面封锁是造成这种状态的主要原因。1959年古巴革命胜利后，美国于1961年与古巴断绝外交关系，随后关闭使馆。次年，美国宣布对古巴实施经济、金融封锁和贸易禁运。

　　关塔那摩湾位于古巴东南部关塔那摩省首府关塔那摩市南面约20公里，是世界最佳海湾之一。美国中央情报局的国别数据统计表显示，美国海军关塔那摩基地的边界线长28.5公里，面积约117平方公里。